Le Conseil scientifique est composé des membres du comité de direction et de six personnalités hautement reconnues par la communauté médicale et scientifique, nommées pour une durée de 5 ans renouvelable. Ce comité est consulté pour les questions relatives aux orientations et à la mise en œuvre de la politique de recherche et de formation du DHU.
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| Pr Charles DECARLI | Department of Neurology UC Davis Medical Centre, Sacramento,USA |
| Pr Costantino IADECOLA | Brain and Mind Institute, Weill Cornell Medical College, Cornell University, New York, USA |
| Pr Patrik MICHEL | Service de Neurologie, CHUV Lausanne, Suisse |
| Pr Thierry MOULIN | Service de Neurologie, CHU Besançon, France |
| Pr Karen FURIE | Stroke service, Massachusetts General Hospital, Boston, USA |
| Pr Geoffrey DONAN | The Florey Institute of Neuroscience and Mental Health, Victoria, Australie |